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同种异体移植是一种关键的分子机制,支持多种细胞过程中的控制和调节1,2。变构效应是指在生物分子的主要功能位点上通过结合远处的效应物而诱导的效应,例如,结合调节酶催化速率的辅因子3。尽管这些过程很重要,我们仍然不了解变构位点的相互作用如何在蛋白质中传播并影响活性位点。在这里,我们提出了一种图论方法,使用原子结构数据来识别蛋白质中的变构位点,以及信号传播中涉及的键和残基。定义一个边到边的传递函数,我们有效地计算出一个键倾向,这个键倾向可以捕捉到由活性位点的扰动对任何键产生的影响。所得的倾向分数预测变构位点和参与调节变构增长的关键键。
同种异体移植是一种关键的分子机制,支持多种细胞过程中的控制和调节1,2。变构效应是指在生物分子的主要功能位点上通过结合远处的效应物而诱导的效应,例如,结合调节酶催化速率的辅因子3。尽管这些过程很重要,我们仍然不了解变构位点的相互作用如何在蛋白质中传播并影响活性位点。在这里,我们提出了一种图论方法,使用原子结构数据来识别蛋白质中的变构位点,以及信号传播中涉及的键和残基。定义一个边到边的传递函数,我们有效地计算出一个键倾向,这个键倾向可以捕捉到由活性位点的扰动对任何键产生的影响。所得的倾向分数预测变构位点和参与调节变构增长的关键键。